由于被陷害参与暗杀，失落的忍者家族必须以自己的方式对抗地下核掩体中的超自然强敌——变异者和食人僵尸。被围困在地下千尺，忍者们将直面地狱...在世界末日后的未来，幸存者联合起来组成忍者氏族，失落忍者氏族的代表——凯奇和浪涌兄弟、聋哑人斯凯、特里利恩和玛尔——被召集到地下掩体参加和平会议。每个忍者家族都拥有一种魔力，而失落的忍者家族则掌控着电力。文高是一位受人尊敬的氏族首领，他认为不同的忍者氏族正受到外部力量的威胁。他建议他们联合起来以增加生存机会。尽管这受到了聚集的氏族的热烈欢迎，但他在演讲结束时被暗杀了。三名目击者挺身而出，指认失落忍者部落的首领凯奇就是刺客。凯奇感到困惑并抗议自己的清白，他带领他的部落穿过敌对的人群，到达安全地带。失落的忍者一族分头探索地堡；每人都击退了几个对手，尽管马尔最终被压倒并被杀。他们埋葬玛尔后，特里莱恩带领他们来到他侦察到的电梯。他们通过贝克尔指挥的忍者进行战斗，贝克尔是敌对忍者氏族的首领，使用火力，每个氏族都指责对方是文隆的刺客。然而，电梯是一个诱饵，它把他们带到了底层，失落的忍者一族在那里遇到了成群的僵尸。万亿被咬，族人惊慌。浪涌和凯奇争夺部落的领导权，直到天空介入阻止他们。文高的副官浩重复发来信息，揭示了第二部正在运行的电梯的存在，但在他给出位置之前电梯就停了。族人奋力冲破丧尸到达工作电梯，幸存者士气低落，继续前行，却被海妖氏族阻止，这是一个由看似克隆人组成的全女性氏族。海妖一族最初是友好的，后来引诱失落忍者一族，然后恶毒地攻击。万亿被杀，浪涌中毒。凯奇和苏奇奋力冲向出口，贝克尔再次与他们对峙。凯奇和贝克尔互相争斗；当凯奇饶了贝克尔一命时，贝克尔质疑凯奇是否有罪。当凯奇和浪涌停下来取药时，凯奇的替身出现并刺伤了浪涌。宏透露自己是变形者，并说他杀死了文隆是为了防止凯奇成为文隆的新副官。凯奇的力量被削弱，力量也耗尽，他被浩打败了。在浩杀死凯奇之前，浪涌恢复并杀死了浩。随后，贝克尔，